Les élèves internes attributaires d'une bourse nationale de collège ou d'une bourse de second degré de lycée bénéficient d'une prime à l'internat. Cette prime est soumise aux mêmes règles de gestion que la bourse. Son versement est effectué trimestriellement.
Le montant annuel de la prime à l'internat est fixé par arrêté des ministres chargés de l'éducation et du budget.